شهدت العاصمة السودانية الخرطوم، الأحد 25 أكتوبر/تشرين الأول 1998، الإعلان رسميا عن مبادرة يقودها أمير قطر الشيخ حمد بن خليفة آل ثاني لتحقيق المصالحة بين السودان وإريتريا بعد أربع سنوات من القطيعة.
شارك أمير قطر الشيخ حمد بن خليفة آل ثاني، الثلاثاء 30 يونيو/حزيران 1998، في احتفالات السودان بالذكرى التاسعة لـ”ثورة الإنقاذ الوطني”، ليكون بذلك أول زعيم خليجي يزور الخرطوم منذ الغزو العراقي للكويت عام 1990.
برعاية مباشرة من أمير قطر الشيخ حمد بن خليفة آل ثاني، وقعت الخرطوم وحركة “التحرير والعدالة” في الدوحة، الخميس 14 يوليو/تموز 2011، الوثيقة النهائية للسلام في إقليم دارفور غربي السودان، بعد أكثر من عامين ونصف من المفاوضات.
أسفرت جهود أمير قطر الشيخ حمد بن خليفة آل ثاني عن اختراق جديد في مسار السلام بإقليم دارفور غربي السودان، حيث شهدت الدوحة مساء الثلاثاء 23 فبراير/شباط 2010 توقيع اتفاق إطار ووقف إطلاق نار بين الخرطوم وحركة “العدل والمساواة”، كبرى الفصائل المسلحة في الإقليم.
بحث أمير قطر الشيخ حمد بن خليفة آل ثاني مع الرئيس السوداني عمر البشير، السبت 21 فبراير/شباط 2009، سبل اتخاذ “خطوات عملية” لدعم الاتفاق الموقع في الدوحة أخيرا بين الخرطوم وحركة “العدل والمساواة” الناشطة بإقليم دارفور غربي البلاد.
قاد أمير قطر الشيخ حمد بن خليفة آل ثاني قمة ثلاثية بالدوحة، الثلاثاء 6 مارس/آذار 2007، جمعته بالرئيس السوداني عمر البشير ونظيره الإريتري أسياس أفورقي، وأسفرت عن توقيع اتفاق لتنمية المناطق الحدودية بين السودان وإريتريا، في خطوة جديدة على طريق دعم الاستقرار في القرن الإفريقي.